El programa de doctorado de la SEPI-ESE se vincula con los sectores académico, público, privado y social mediante la realización de estudios especializados sobre temas de interés para cada sector.
Director: Dr. Gerardo Aguilar Gutiérrez 2017 Fondo Institucional del Conacyt para Atender Problemas Nacionales
Directora: Dra. Ana Lilia Valderrama Santibáñez 2013 Fondo Sectorial de Innovación Secretaría de Economía-Conacyt
Participante: Dr. Gerardo Angeles Castro 2013 Secretaría de Investigación y Posgrado y Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación del Distrito Federal. Proyecto de la RED de Desarrollo Económico del IPN
